Svenska Kanotförbundet samarbetar både med nationella och internationella förbund och organisationer.

Svenska förbund

• Riksidrottsförbundet
• Sveriges Olympiska Kommitté
• Sveriges Paralympiska Kommitté
• Parasport Sverige

Svenska organisationer

• Svenskt Friluftsliv
• RF-SISU
• Antidoping Sverige
• Arena Vattnet
• Mistra Sport & Outdoors
• Naturvårdsverket
• Svenska Sjöräddningssällskapet
• Sjösäkerhetsrådet, Transportstyrelsen
• Friluftsfrämjandet
  
• Städa Sverige
• Håll Sverige Rent
  

Internationella förbund

• International Canoe Federation, ICF
• European Canoe Association, ECA
• International Dragon Boat Federation, IDBF
• Danska Kanotförbundet
• Finska Paddlings- och Roddförbundet
• Norska Kanotförbundet
• Tyska Kanotförbundet